公牛队也叫了暂停，利用这个机会，乔丹告诉没有防住伊洛的霍奇斯，不要再为刚刚那个球而烦恼。霍奇斯事后回忆说："迈克尔走过来对我说'别担心'，他说他会把球投进的，于是我说，'去吧，去干吧。'"
那才真是致命的三秒钟。
科林斯制订了两套方案：由塞勒斯在中线发球，卡特莱特给乔丹做掩护，如果乔丹摆脱了伊洛的防守，塞勒斯就把球发给乔丹；倘若第一方案无法奏效，就由皮蓬给霍奇斯做掩护，霍奇斯在底角接球出手。
克利夫兰球迷目睹伊洛这次上篮，有一千一万个理由相信，这是置公牛队于死地的一球。然而，这次配合有一点不够完美：它完成的效率太高，只用掉了三秒钟，还给公牛留下了三秒钟。
谁都明白乔丹会是公牛的第一选择，骑士主帅伦尼·威尔肯斯当然也清楚，所以，他安排南斯去帮助伊洛，从发球开始就围堵乔丹。卡特莱特的掩护没有起到作用，乔丹并未甩脱伊洛和南斯，但负责发球的塞勒斯做了正确的选择，没有着急将球送出，而是看乔丹用假动作骗过南斯，一个变向获得了接球空间。塞勒斯把握住这个机会，将球送到乔丹手里。
终场前6秒，乔丹在右翼45度角命中一记中投，将比分改写为99比98，公牛领先，机会大好。但暂停过后，骑士仅用三秒就完成一次漂亮的传切配合，克雷格·伊洛发界外球，球刚离手就马上往篮下空切，甩掉盯防他的克雷格·霍奇斯，接队友回传上篮得分。100比99，骑士反超。
乔丹接球的位置，在右侧三分线外。"从那儿，我们觉得迈克尔既可以投篮，也可以往篮下突破。"科林斯事后说。
当然，谁都不肯输这一口气。生死战，淘汰赛，谁赢谁就晋级，没有退路。一旦输掉这场球，全队一整年的努力就此终止。打到最后一分钟，最后十秒钟，球馆内的空气都要凝固了，似乎喘一口气，人就能从天堂堕入地狱，或者从地狱飞向天堂。
不过，乔丹对自己罚球的信心并不太足。这场比赛，他13罚仅9中；而前一场球，他27次走上罚球线，共罚丢了5个，其中第四节最后一分钟丢了2个。乔丹说："如果我突进去被犯规了，我不想站上罚球线。"因此，他决定用跳投。
5月7日星期天，在俄亥俄州的富田体育馆，公牛骑士斗得难解难分，最后三分钟，双方竟然还交替领先了9次。
乔丹接到塞勒斯传球，像猎豹一般往左边猛蹿，伊洛那一瞬间伸手捞了一把皮球，这是个毁灭性的错误。乔丹说："他去捞球的时候，给了我一步的空间。于是我变向，起跳，滞空，然后投篮。"
比分：公牛101：100骑士
乔丹来到罚球线上方，起跳准备出手。南斯已被彻底甩开，伊洛却还不依不饶地跟过来试图封盖。好一个乔丹，在这千钧一发之际，竟然来了个长时间滞空，等到伊洛身体下落，才把球投出。
地点：富田体育馆
球进，时间到。101比100，公牛赢了。
时间：1989年5月7日
刚刚落地的乔丹重新弹起在空中，挥舞着拳头，忘情地吼叫。这是他一辈子庆祝动作最放肆、情绪表达最奔放的瞬间。在乔丹激情跳跃挥拳的后方，伊洛懊恼地扑倒在地。整个画面，伊洛完美地扮演了乔丹的配角。正如这场生死之战，如果没有乔丹最后三秒的压哨绝杀，那么伊洛此前三秒的空切上篮，就将成为NBA季后赛经典，但结果，伊洛只是充当了乔丹传奇一投的背景。
1989年NBA季后赛首轮第五场
乔丹的经典进球、经典滞空，深深刺痛了克利夫兰人。赛后更衣室里，乔丹的北卡学弟多尔蒂沮丧地说："我无法相信他投进了那球。我们做对了每一件事。我就是无法相信。我不知道他是怎样在空中停留那么长时间的，这是我见过的最杰出的投篮。"
乔丹生涯经典战之三
这是乔丹在NBA季后赛当中的第一记伟大绝杀。在这之前，乔丹也绝杀过，却没有任何一个如此关键，如此致命，如此影响深远，如此让人刻骨铭心。这记绝杀中投，在NBA史册中有个专属的脆生生的名字，就叫"The Shot"（那一投）。
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这场生死战，乔丹得到44分，抢9个篮板，助攻6次。最后那两分，弥补了两天前第四场绝杀未成和罚球不进的过失。乔丹说："这大概是我在NBA投进的最重要的一个球。主要是因为，我在紧要关头，证明了自己是可信的。我认为我们可以击败他们，但是星期五，我错失了最后的罚球和最后一投，害我们输了，那是我在篮球场上最低落的时刻。就好像我高中时没进得了校队那样，我对自己非常失望，眼泪都出来了。"
第四场，乔丹狂取50分。连续两年季后赛跟骑士交手，这已是乔丹第三次单场得分上50。不过这回，在第四节最后一分钟，乔丹错失了两记关键罚球，压哨一投也没中，才把骑士放进了加时，结果骑士以108比105获胜。这样一来，公牛不得不再赴克利夫兰，在对方球迷的包围中打一场定生死的淘汰赛。
如果The Shot没能成为The Shot，那么乔丹可能会在很长一段时间里纠结于自己连续两场错失绝杀，难以自拔。幸好，那球进了，保存并滋长了乔丹的信心。乔丹对媒体说，这球甚至比他在1982年NCAA全美决赛中投进的那球还要棒。准确地说，这是乔丹成为NBA季后赛头号杀手的开始，也是公牛后来在20世纪90年代构建伟大王朝的引子。长远来看，The Shot是乔丹在1989年获得的最大财富。
系列赛拉开帷幕，第一场公牛就先声夺人，在对方地盘上以95比88取胜，这为后面的对决打下了坚实基础，乔丹此役贡献31分、11次助攻。第二场，骑士扳回一城。第三场转战芝加哥，乔丹攻下44分，另有10次助攻、7个篮板，用准三双的表现带领公牛再度取胜，101比94。当时NBA季后赛首轮采用五战三胜制，总比分2比1领先的公牛已经手握赛点。前三战，乔丹场均不仅能得35分，而且助攻10.3次。
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乔丹可不愿意接受别人安排好的结局，后来他说："如果你接受了别人的预判，尤其是那些消极的预判，你就永远改变不了结果。我相信，没人能决定或者规定我所参加的比赛的结果。在克利夫兰，我们队没人相信我们会输。我们可以自己决定结果。自从高中被校队拒之门外以来，我就一直坚持这样的态度。"
总比分3比2淘汰骑士，公牛闯过首轮，挺进东部半决赛，迎战纽约尼克斯。尼克斯常规赛打出52胜，东部二号种子，和他们交手，公牛当然又是处于弱势的一方。但经过首轮，形势发生了变化，至少在心理层面发生了变化。骑士比尼克斯还强，成绩比尼克斯还好，公牛照样赢了，那么斗倒尼克斯有何不可呢？现在，公牛成为东部下半区的一颗炸弹。
那支骑士当真不是好捏的软柿子，他们阵容齐整，以白人控卫马克·普莱斯和北卡状元中锋布拉德·多尔蒂为核心，辅以罗恩·哈珀、拉里·南斯、克雷格·伊洛、约翰·威廉姆斯，每个位置都有正值壮年的优秀球员，所以"魔术师"约翰逊才会大胆预言，骑士将成为NBA"90年代的王者球队"。
和首轮打骑士一样，对尼克斯这个系列赛的第一战，公牛又在客场先声夺人，取得开门红。两战过后，双方打成1比1平。接下来转战芝加哥，按照NBA当时的赛程安排，两队要打"背靠背"，第三场在星期六下午打，第四场在星期天晚上打。
季后赛首轮，公牛的对手又是骑士。1988年，公牛是东部三号种子，骑士是东部六号种子，两队首轮相遇，公牛享有主场优势。现在1989年，双方地位逆转，骑士成了东部第三，公牛掉到东部第六，主场优势归了骑士。况且，说是东部第三，骑士的真正实力犹在排名之上----常规赛，他们比公牛多赢10场球，57胜25负的成绩和西部第一的湖人并列，高居全联盟第二，仅次于同属中区的活塞，只不过根据NBA的排名规则，大西洋区榜首的尼克斯自动成为东部二号种子，骑士明明比尼克斯多赢5场球，也只能以三号种子的身份进入东部季后赛，这才得以和公牛重逢。公牛常规赛六战骑士，无一胜绩，因此系列赛开打之前，没人相信他们能爆冷，相反，倒有不少人觉得骑士可以横扫公牛。
对尼克斯而言，这是个噩梦般的周末。
事实上，对乔丹和芝加哥公牛队而言，1988----1989赛季并不是失败的一年，乔丹更不是一无所获。常规赛，公牛成绩退步了，但季后赛是全新的起点，东部排名第六的球队，仍然有机会走得很远很远。
第三场的第二节，乔丹在做一个360度转身动作时拉伤了大腿，旧伤加重，但他还是忍着痛，一次次起跳出手得分。光第二节，乔丹就有16分进账，公牛因此在上半场取得20分的优势。已为尼克斯效力的奥克利说："我都不明白发生了什么。我上场努力打球，接下来所知道的，就是我们落后20分了。"那场公牛以111比88大胜，乔丹全场攻下40分，抢了15个篮板，助攻9次，只差一次助攻就是个大号三双，另外还有6次抢断。
这个赛季结束得很不愉快。常规赛最后10场球，公牛输掉了8场，47胜35负的成绩没有达到管理层的预期。赛季结束后，科林斯被炒，杰克逊上台，乔丹迎来自己在NBA的第四任主教练。
乔丹赛后没有接受采访，去做肌肉治疗了，记者们只好努力从尼克斯主帅里克·皮蒂诺（Rick Pitino）那里多挖点东西出来。皮蒂诺倒是乐观，他说："我想我们的一大关键是，我们把迈克尔·乔丹留在比赛里，留到了最后。"记者们很诧异，想知道皮蒂诺是不是开玩笑，可皮蒂诺是认真的，他的理由是：乔丹打了快40分钟，有可能影响到下一场，因为24小时之后，第四战就要开打。
几星期后，杰克逊去迈阿密考察热火队，却因为旅行计划的问题错过了比赛。第二天，克劳斯给他打来电话，认真地告诫他：这个赛季剩下的时间，再也不要错过任何一场比赛。显然，有什么事要发生了。
皮蒂诺在美国名气很大，他不仅是一个出色的篮球教练，而且是一个优秀的演说家，常常去给生意场上的高管们做激励性演讲，挣了不少钱，甚至写过一本与此相关的畅销书。不过，激励有时也会对自己不利，因为你可能一不小心就激励了自己的对手，比如乔丹。
科林斯怒了。在他看来，这就像一场阴谋。第二天，他面色铁青地指责菲尔·杰克逊拆他的台，破坏他的执教哲学，还说杰克逊跟克劳斯站在一边，密谋对付他。不久，科林斯、克劳斯、杰克逊三人进行了一次时间很长但很不愉快的会谈，经过那次会谈，科林斯和杰克逊的友好关系荡然无存。
第三场打完当晚，也就是星期六晚上，乔丹一边在训练师的指导下进行治疗，一边观看电视体育新闻。突然，皮蒂诺出现在电视上，言语之中暗示：乔丹可能是假装受伤，目的是提升外界对他的关注。一听这话，乔丹噌地坐了起来，他后来说，皮蒂诺的话让他非常生气，"他根本搞不清我的状况，我认为那些言论是非常不恰当的。我比任何人都了解我的身体。所以，我决定把他的话转化成动力"。
这场胜利刺痛了科林斯，尤其令他心中不爽的是，克劳斯那天带着妻子塞尔玛（Thelma Krause）坐在看台上，旁边就是杰克逊当时的妻子茱恩（June Jackson），电视镜头拍到他们三人一块儿看球，后来回芝加哥，这一画面还在电视上反复播放。多年后提起这件事，茱恩·杰克逊还说，当时接受克劳斯夫妇的邀请，是个"重大的政治错误"。
皮蒂诺也许只是开个玩笑，但这玩笑开过头了。第二天，系列赛第四场，乔丹拖着一条受伤的腿，在场上狂砍47分，并且抓下11个篮板，率领公牛以106比93获胜。赛前热身，乔丹走路还有点一瘸一拐，但随着比赛的进行，他状态越来越好，第四节独得18分。
1988年圣诞节之前，一场对雄鹿的客场比赛，科林斯早早被罚出场，他把指挥权交给杰克逊，临走前把自己想打的战术全安排给杰克逊。当时公牛落后了不少，因此杰克逊根本没管科林斯想让球队打什么，抛弃了科林斯那些战术，只拼命强调防守，进攻端就让球员按照他们自己觉得舒服的节奏来。结果，杰克逊的方法奏效了，公牛完成逆转，击败对手。
一个周末，公牛连赢两场，总比分3比1领先，而乔丹两天之内独取87分。尼克斯当家球星尤因说："一切都不在我们的控制中，球就是投不进，而迈克尔看上去好像怎么投怎么有。"
当科林斯与这支球队越来越不相容时，菲尔·杰克逊却和每个人相处得很融洽。他和巴赫很亲近，巴赫教会了他很多有关球探报告的东西。他对温特也很友好，甚至跟克劳斯相处得也不错，只是他没想到，自己会是潜在的主教练候选人。
最终，公牛以4比2击败尼克斯，乔丹职业生涯首次突破季后赛第二轮。从这一年起，乔丹成为克利夫兰骑士和纽约尼克斯的克星，只要有他在，那两支队伍在季后赛当中逢公牛必败。
科林斯与克劳斯之间的直接矛盾也日益激化，两人在选秀、人事决定以及其他一些事情上经常作对。1988年，科林斯就公然挑战克劳斯：为什么你老是和教练一块儿出现？为什么你老是随队去客场？克劳斯回答：因为我是总经理啊！科林斯就说：总经理不需要跟着球队到处跑。全队训练，科林斯只要看见克劳斯在，就会冲他大吼："为什么你又在这儿？你来球场干什么？"这样的争吵，已经无关球队工作，完全是个性与尊严的对抗。
登上东部决赛的舞台，公牛的对手是他们的宿命之敌----底特律活塞。1989年的活塞队，经历过前一年总决赛的洗礼，实力比以往任何时候都要强大，他们常规赛取得63胜19负，季后赛前两轮又连续横扫凯尔特人和雄鹿，独孤求败。
出于对控卫的长期不满，科林斯这个赛季让乔丹改打控卫。调整之后，效果确实不错，但这迫使乔丹在常规赛消耗过大。就这个问题，科林斯有一次和温特展开了激烈的讨论。温特提出，如果科林斯能建立一套真正的进攻体系----不一定非要三角进攻，只要有成形的体系就行----公牛队就不必如此依赖一名控卫来主导进攻。科林斯听了很不高兴，他受够了温特没完没了的批评，他决定撤去温特的教练职权，任由他去。于是在公牛队的训练中，出现了这样的奇特场景：教练们围到一起，只有温特一人坐在旁边，拿本子做着笔记，就好像他不是公牛助教，而是其他球队派来研究公牛队的。温特与教练组其他成员割裂开来，这不是什么好征兆。温特曾对科林斯说："道格，对于一个像你这么聪明的人，我经常想知道，你到底知不知道自己在干什么。"克劳斯听说科林斯架空了温特，顿时对科林斯的判断力丧失信心。居然会有人开除一个像泰克斯·温特这样的助手？
即便面对如此强大的对手，公牛一往无前的气势也没有减弱。东部决赛前三场打完，总比分2比1，领先的居然又是公牛。和前两轮一样，公牛先在客场偷得首胜，带着1比1平的总比分回到芝加哥后，又在主场取得领先。
在科林斯手下打球，球员们要记四五十套战术，然后到比赛中，科林斯在场边阅读防守，根据他自己所看到的，指挥球员这个回合打哪套战术，下个回合又打哪套战术。这种执教风格在NBA很罕见，倒挺适合科林斯本人，因为他的确拥有杰出的观察和阅读能力，应变奇快。但这样做的坏处是，久而久之，球员们在场上过于依赖他的判断，失去了主动性，也容易错过那些转瞬即逝的好机会。科林斯的执教，把乔丹身边的其他球员日益边缘化。太多时候，公牛队的进攻就是其他四个人尽量拉开，给乔丹创造空间，然后站在旁边看乔丹展示他的魔力。
第三场特别值得一提。最后八分钟，公牛曾落后14分，到比赛结束前四分钟，活塞仍以91比83领先，但在乔丹的率领下，公牛追了上来。终场前28秒，双方战成97平，活塞叫暂停，戴利安排托马斯和兰比尔打挡拆。助理教练布伦丹·苏尔（Brendan Suhr）说："非常安全的战术，我们的基本战术之一，这是我们选择用它的原因。"托马斯接球，乔丹防他，托马斯把时间耗到剩11秒左右，兰比尔提上掩护。托马斯向右突破，乔丹紧追不舍，在弧顶，乔丹撞上兰比尔，哨声响起，裁判比尔·欧克斯（Bill Oakes）吹兰比尔进攻犯规。戴利坐在场边都看傻了，双手把脸捂住。兰比尔对裁判给予乔丹的特殊待遇颇为不满，他赛后刻薄地说："我知道不管什么时候，当一个球跟迈克尔·乔丹有关时，你就得留神了，你要确保自己不会碰到他。可我在那个时候没有考虑这些，我只想着恰当地做好我的工作。我的确恰当地做好了我的工作，我做了个常规的掩护，就像我一年一千次所做的那样。"
不用三角进攻，那科林斯的战术体系是什么呢？正如乔丹所说，"道格从来没有过一个真正的体系"。科林斯不停地给球队加战术，如果对手在和公牛比赛时用了个有效的战术，第二天，科林斯就会把它加到公牛的"战术体系"里来。球员们给科林斯的体系取了个名字，叫"一天一套战术"（A play a day）。
时间还剩9秒，活塞要尽全力阻止乔丹拿球，他们派出自己最好的防守球员罗德曼来对付乔丹。罗德曼确实干得不错，乔丹好不容易挣脱他，跑到中线附近才接到球。乔丹向右走，罗德曼始终跟在他身边，没有失位，同时托马斯还在禁区边候着，准备包夹。乔丹没有退让，也没有分球的打算，他大跨步起跳，跳到托马斯头上，几乎是骑着托马斯把球投出的，球打板入筐。
公牛队想推行三角进攻，是希望在展示乔丹独一无二进攻天赋的同时，也让其他球员更好地融入进来。但这样的希望没有转化成现实，乔丹对三角进攻很不感冒，科林斯对三角进攻也谈不上任何信仰。
凭借这记终场前3秒命中的投篮，公牛以99比97击败活塞。乔丹第四节独得17分，全场26投16中，贡献46分、7个篮板、5次助攻和5次抢断。罗德曼赛后面对记者，只扔下一句："我什么都不说。"
温特是克劳斯在教练界结交的最老也最亲密的朋友。很早以前，克劳斯就跟温特说：如果有一天我能当上NBA球队的总经理，你会是我头一个聘用的人。温特当时没当回事。后来1985年，63岁的温特在路易斯安那州立大学做助教时，有一天，他从ESPN上看到一条新闻，说克劳斯被任命为芝加哥公牛队的总经理，温特就告诉妻子南希（Nancy Winter）：我接到的下一个电话，会是这个人打来的，他会给我一份新工作。温特说对了。
东部决赛输给公牛的这两场，是活塞在1989年季后赛中仅有的两场败仗。后来总决赛面对湖人，他们也一场未输，4比0横扫夺冠。
与此同时，科林斯和克劳斯之间的裂痕也越来越大。科林斯刚上任时，两人曾达成共识：不仅泰克斯·温特会担任科林斯的助手，而且温特的"三角进攻"也会成为球队的基本战术体系。科林斯做过尝试，但没用多久他就抛弃了三角进攻，因为三角进攻和他所信奉的防守原则有冲突。科林斯觉得，三角进攻这种东西只适合大学，不适合职业篮球。
从东部决赛第四场开始，活塞没有再给乔丹机会，他们继续动用"乔丹规则"，举全队之力封锁乔丹的进攻。第四场，乔丹只得23分，15投5中；第五场，乔丹只得18分，8投4中；第六场，乔丹得了32分并助攻13次，却有8个失误。活塞终以4比2的总比分获胜晋级。六场东部决赛，公牛没有一场得分破百。
乔丹顾及自己超级明星的身份，在公开场合说话，通常很小心，尽可能不去挑战权威----当然，克劳斯不算----但乔丹身边那些人，都能慢慢察觉到他对科林斯的质疑。乔丹跟自己的朋友说，科林斯是个"非常情绪化的年轻教练"。
1989年季后赛，乔丹为公牛创造出惊喜，但并未改变结局，活塞仍是公牛无法逾越的障碍。
适当地放手，接受一些本不该有的失败，是NBA主教练应当具备的一项重要素质，而科林斯偏偏不是一个愿意撒手不管的人。他公开说："我就是这个样子，我按照自己的方式执教。"但因为他过于情绪化，到第三年，球员们不干了，他们开始抱怨科林斯的执教方式，他们觉得在科林斯手下打球，心情就像坐过山车一样，前一天他还冲你大吼大叫，后一天他就给你一个拥抱，告诉你他有多爱你。一般来说，球员更加情绪化，教练相对老练平和，而公牛队却不是这样。
那年休赛期，乔丹逾越了一道障碍，完成了一件人生大事：结婚。
37岁的科林斯执教公牛已是第三个赛季，他开始失去球员的支持。没人质疑科林斯的头脑，但有一点他总做不到，那就是适当地无为而治。几位老助手经常提醒他：偶尔试着放手，不要管得那么紧，有时候输了球，特别是输了那些教练们认为不该输的球，也要给球员一定的空间。
嫁给乔丹的女人名叫胡安妮塔·范诺伊（Juanita Vanoy），这一年她30岁，比乔丹大了将近4岁。当然，年龄不是问题，身高不是距离，胡安妮塔后来说过，乔丹"很快向我证明他够成熟，能和我在同等成熟的水平上进行交往"。
卡特莱特刚来，球员之间需要磨合，这是公牛成绩退步的重要原因，但并非全部。这一年，队内还有其他的不和谐因素。
乔丹和胡安妮塔最早是在一家餐馆经朋友介绍认识的，那是1984年的事。过了几星期，两人又在朋友聚会上重逢。大约半年之后，到了1985年，他们成为稳定交往的男女朋友。认识乔丹之前，胡安妮塔就是一个努力、上进、有抱负、有主见的聪明女人，她当过模特，又在美国律师协会做过执行秘书，和乔丹相识的时候，她是一名信贷员。
论能力之全面，论数据之华丽，这甚至可以算作乔丹职业生涯的巅峰赛季。但因为公牛队成绩不如人意，乔丹在年度MVP的评选中排名第二，输给了率领湖人队打出57胜25负的"魔术师"约翰逊。魔术师场均拿22.5分，助攻12.8次，抢7.9个篮板，投篮命中率50.9%，这同样是他在NBA数据最漂亮的年份之一。
两人交往了几年，到1987年的最后一天，乔丹在芝加哥市区一家高档餐馆向胡安妮塔求婚，胡安妮塔点头答应。原以为这就算好事成了，可接下来，婚期被搁置，半年时间过去，竟然闹到要对簿公堂的地步。
如他自己所说，乔丹在1988----1989赛季化身成为超级三双王，不仅继续拿高分，而且做了太多得分以外的事情。1989年3月末到4月初，乔丹曾连续七场打出三双，中断一场后，又接连奉上三个三双----连续11场比赛，乔丹交出10个三双；那11战，他的场均贡献是33.6分、10.8个篮板、11.4次助攻，投篮命中率51.0%。
1988年7月11日这天，胡安妮塔找到一位名叫迈克尔·明顿（Michael Minton）的律师。"她告诉我她怀孕了，还没结婚，而孩子的父亲是迈克尔·乔丹，"明顿多年后回忆说，"她感觉如果不找一个合法代理人登记备案，就不可能得到迈克尔的关注、配合与回应。"
虽然有五个月的身孕，胡安妮塔看上去既不愤怒也不悲痛。她衣着得体，落落大方，只是内心无比坚定。明顿说："她受过非常好的教育，而且她非常实际。她知道自己必须做什么，一点都不优柔寡断。"
不过，当时队里有很多摩擦，尤其是在道格和某些年轻球员之间，但我还是明白，我们已经向前迈了一步。常规赛期间，我们输掉了对克利夫兰的全部六场比赛，也输掉了对底特律的全部五场比赛，可到季后赛开始时，我真的觉得，我们可以击败任何人。
胡安妮塔物色律师已经物色了一些日子，和明顿谈过之后，她决定雇用这个人，让明顿代表自己向乔丹提起诉讼。明顿联系了乔丹，跟乔丹讨论了胡安妮塔的情况，乔丹当时几乎什么话都不说，对胡安妮塔及其肚子里的孩子不做任何表态。明顿告诉乔丹：你唯一的选择，就是自愿承认胡安妮塔的孩子是你的，然后双方再协商解决婚姻问题。很快，乔丹把这件事情转交给自己的律师处理，两边开始了长达两年半的漫长谈判。
奥克利走，卡特莱特来，我就知道自己必须多抢篮板。然后，斯科蒂和霍勒斯成为先发，我又知道自己必须想办法让他们融入到进攻中来。道格做了一切尝试，包括赛季末段让我去打组织后卫。那是整个赛季第一次一切开始运转正常。我们有一段在14场比赛当中赢下11场，而我也一度在11场比赛里10次打出三双。我可以看到整个球场，对手不再能把防守精力集中到我一个人身上。那是我职业生涯第一次，我们队有了其他的得分选择，对手必须尊重我的队友。
熟识胡安妮塔的人都清楚，胡安妮塔从来没有因为乔丹的金钱、名望、地位而畏惧过他，她知道自己所处的位置。1988年11月，胡安妮塔把孩子生了下来，孩子的出生证上就写着乔丹的名字。这是乔丹的第一个孩子，他们给他取名叫杰弗里·迈克尔·乔丹（Jeffrey Michael Jordan）----"杰弗里"是乔丹自己的中名，乔丹的全名就叫迈克尔·杰弗里·乔丹。
可是，我知道自己在球场上能干些什么，这是挑战倾向于精神层面的原因。我必须把我的能力融合到一个体系里，那个体系能让球队变得更好。道格（科林斯）从来没有过一个真正的体系，因为他依赖个人天赋。从这个意义上说，要让球队变得更好，我就需要有合适的球员在我身边。随着霍勒斯·格兰特和斯科蒂·皮蓬开始成长，比尔成为低位的威胁，这一切开始发生。不过，它并不是一夜之间发生的。
乔丹与胡安妮塔之间的事情，对外保密做得极好，媒体根本不知道乔丹已经当了父亲。直到1989年3月，《体育画报》记者杰克·麦卡伦（Jack McCallum）造访乔丹家，乔丹消失了一会儿，随后带着胡安妮塔和四个月大的杰弗里出来见麦卡伦。乔丹介绍说："这是我女朋友。这，是杰弗里·迈克尔。"脸上满是自豪。麦卡伦惊得目瞪口呆，他不敢相信自己和所有媒体同行居然都错过了这样的大新闻。乔丹很在意自己的公众形象，他希望由他自己来对外发布这一消息，可麦卡伦说，作为职业记者，他没法假装不知道乔丹已经有了个儿子。后来，麦卡伦在文章中提到这点，外界才知情，乔丹为此还生了麦卡伦的气。
他们指出，威尔特（张伯伦）、多米尼克·威尔金斯、鲍勃·麦卡杜（Bob McAdoo）这些人，都得了很多分，但他们所效力的球队，都不像他们个人那么成功。乔治·迈肯（George Mikan）之后，卡里姆·阿布杜尔----贾巴尔是唯一既能当上得分王又能率领球队夺冠的球员；而中锋之外，从来没有球员在同一个赛季做到过这两点。对那些成天想着批评我的人而言，历史提供了一个伟大的论据，因为我个人远比我的球队成功，所以我肯定没有让身边的球员变得更好。
1989年9月2日，凌晨三点半，乔丹和胡安妮塔在拉斯维加斯著名的小白教堂秘密举行婚礼，乔丹给胡安妮塔戴上了一枚五克拉的大钻戒。这场婚礼办得简单明快，仪式只花了10分钟，到场宾客仅有四人。婚后不久，乔丹在接受采访时说："我很开心，结婚是件大事，它帮助我成熟起来。"
婚是结了，但两人的婚前协议还没签，财务协商仍在进行。这件事在他们婚后又拖了一年半时间，直到1991年2月才彻底完成。在这期间，胡安妮塔已经为乔丹生下了第二个儿子马库斯（Marcus Jordan），乔丹拥有了一个完整的美国式家庭。
1988----1989赛季
1988----1989赛季开始时，挑战不再是身体上的，更多的是精神上的。人们认可我是一名伟大球员，但批评还是一样：只要迈克尔·乔丹在得分上领衔全联盟，公牛队就永远拿不到总冠军。
常规赛：81场，32.5分，8.0篮板，8.0助攻，2.9抢断，投篮命中率53.8%
季后赛：17场，34.8分，7.0篮板，7.6助攻，2.5抢断，投篮命中率51.0%
公牛退步，不是因为乔丹退步。乔丹常规赛打了81场，平均每场得32.5分，抢8.0个篮板，助攻8.0次，投篮命中率53.8%，虽然个人得分不像前两个赛季那么夸张，但总体表现是在稳步提升，没有半点退步之嫌。事实上，这个赛季刚开始，乔丹就意识到了挑战，做好了心理建设，多年后在自传中回顾到这个赛季，他写下这样一番话：
NBA年度最佳阵容第一队
1988----1989赛季，是乔丹在NBA的第五个年头。前面四年，除去受伤的1985----1986赛季，乔丹总能率领球队取得进步，而这次，从数字上看，公牛退步了----常规赛，公牛取得47胜35负，比前一个赛季少赢3场，在中区仅排名第五，在东部掉到第六。
NBA年度最佳防守阵容第一队
卡特莱特加盟公牛的第一个赛季，全队磨合得很痛苦。过去几年，公牛的进攻都是围绕着乔丹来展开的，现在突然塞进一个习惯在低位背身单打的攻击点，乔丹不知该如何为卡特莱特做调整，卡特莱特也不知该如何为乔丹做调整，两人就这样不尴不尬地将就着。
NBA得分王