玛·莎拉和乔·莎拉遭受了同一命运，被星灵毁灭，吉姆·雷诺、阿克图尔斯·蒙斯克、“克哈之子”以及部分行星居民逃出生天。
一名联邦陆战队员安多·梅尔尼科夫发现自己陷入了玛·莎拉的纷争。他承受着行星邦蒂富尔的痛苦回忆，但很快，他发现隐藏在自己身上的真相更加黑暗。
吉姆·雷诺感到被联邦所背叛，于是他加入了“克哈之子，”并与莎拉·凯瑞甘相识。一名联邦电视新闻网的记者——迈克尔·利伯蒂伴随着反抗力量，一路报道反击联邦的新闻宣传。
在玛·莎拉行星，吉姆·雷诺摧毁了死水基地——一个被异虫感染的人类前哨站，并因此被联邦监禁。不过很快，蒙斯克的反抗部队“克哈之子”来到此地，吉姆·雷诺获救。
一名联邦政客汤姆森·考利派遣“好战者”——这是一支专为联邦处理各种肮脏工作的秘密部队——刺杀阿克图尔斯·蒙斯克。不过刺杀行动失败。
另一方面，在附近的玛·莎拉行星也发现了异虫的活动迹象。
十一月。“诺娃”特拉——一名塔桑尼斯行星联邦精英的女儿，在她感应到父母兄弟被杀后，领悟了自己潜在的灵能。在得知其恐怖能力之后，联邦政府将其抓获，并试图利用她的天赋能力。
科普卢星区出现了两类异族威胁：残酷无情，拥有极强适应能力的异虫和神秘莫测的星灵相继出现于此。星灵对属于泰伦联邦的行星“乔·莎拉”突然发动攻击，联邦政府非常愤怒。而大部分泰伦人不知道，乔·莎拉行星已经完全被异虫所感染侵占，星灵的攻击在于毁灭这些入侵者。
阿克图尔斯·蒙斯克在联邦首都塔桑尼斯行星部署了毁灭性武器——灵能发射源。这个装置可以将灵能放大发射，引来大批异虫。首都塔桑尼斯行星就此沦陷，这给了联邦政府致命的打击。
星际纪元2499-2500年
阿克图尔斯·蒙斯克背叛了莎拉·凯瑞甘，将其遗弃在塔桑尼斯的虫群之中。愤怒的吉姆·雷诺退出“克哈之子，”并组织了自己的反抗部队——“雷诺的游骑兵”。很快他发现了凯瑞甘的下落：凯瑞甘并未被异虫所杀，而是被异虫主宰变异成为一个新的强大存在——刀锋女王。
泰凯斯·芬利被当局逮捕，吉姆·雷诺结束了犯罪生涯，在玛·莎拉行星开始了联邦治安官的新生活。
阿克图尔斯·蒙斯克宣布登基为皇帝，控制众多泰伦行星的帝国在科普卢星区成立。
星际纪元2495年
帝国参议员科尔宾·弗尔斯，发现他的幼子科林拥有能够吸引异虫军队的灵能，帝国认为这是一件可以利用的武器。
为了震慑其他可能存在的分裂势力，联邦政府对克哈IV进行了核打击，数百万人死亡。作为报复，阿克图尔斯·蒙斯克将他的反抗部队命名为“克哈之子，”并加强了对联邦的武装反抗。这段时期，阿克图尔斯解救了一名联邦幽灵——莎拉·凯瑞甘，之后她成为了蒙斯克的副指挥官。
在边缘之地贝卡·鲁行星，泰伦、星灵和异虫三个势力因萨尔纳加遗迹的归属，而展开战斗。萨尔纳加被认为是一个古老的种族，可能影响过异虫和星灵的进化过程。
星际纪元2491年
异虫最高统治者“主宰，”发现了星灵母星，艾尔行星的位置，异虫大批入侵。但英勇的高阶圣堂武士塔萨达尔与主宰同归于尽。然而艾尔行星的大部分已遭毁灭，剩余的星灵舰队通过萨尔纳加传送门来到了黑暗圣堂武士所在的的萨古拉斯行星。这是黑暗圣堂武士从艾尔行星被流放后，双方的第一次接触。两个星灵社会重新统一。
阿克图尔斯·蒙斯克的父亲宣布行星克哈IV独立，一直同联邦政府争执不断。作为回应，联邦政府派遣了三名幽灵（经过联邦政府秘密训练，拥有强化灵能的超级士兵）刺杀了阿克图尔斯的父母以及他的妹妹。阿克图尔斯悲愤欲绝，他接过了克哈反抗力量的领导权，并掀起了反抗联邦的游击战。
异虫通过传送门尾随星灵难民来到萨古拉斯。吉姆·雷诺同塔萨达和黑暗圣堂泽拉图结盟，留在艾尔行星负责关闭传送门。与此同时泽拉图和星灵执政官——阿塔尼斯，利用远古的遗迹——萨尔纳加神庙的力量，净化了被异虫完全侵袭的行星。
在凯联之战四年后，联邦政府通过和凯莫瑞安联合体的“和平谈判，”分化了凯莫瑞安联合体几乎所有的矿工行会支持者。尽管受到如此大的挫折，凯莫瑞安联合体仍获允继续存在，并得到了自治权。
UED（地球联合理事会）观察到了三族间的战斗，他们从地球来到科普卢星区，意图接管统治。为了达到此目标，UED在异虫占领的查尔行星捕获了新生的主宰幼虫。刀锋女王、蒙斯克、雷诺以及星灵此时抛开了彼此的纷争，试图合作击败UED和新生的主宰。这个不可能的联盟杀死了第二主宰，刀锋女王目标实现，接管了科普卢所有的异虫。
与此同时，阿克图尔斯·蒙斯克在获得上校军衔后从联盟军队退役。之后他成为了银河系边缘一名成功的勘探者。
在查尔的一颗未知卫星上，泽拉图遭遇了萨米尔·杜兰，刀锋女王的前盟友。他发现杜兰已经成功将异虫和星灵的DNA混合，创造了一个新物种。杜兰预言这个新种族将会永远改变这个宇宙。
在凯联之战结束前，吉姆·雷诺和泰凯斯·芬利决定自行脱离联盟政府军队。
阿克图尔斯·蒙斯克消灭了半数的幽灵，为确保他们对自己忠心不二，他接管了前联邦政府的幽灵计划，并将其融入帝国的幽灵项目。此外，他在行星克哈IV的一个卫星马上建立一个新的幽灵军校。
吉姆·雷诺在凯莫瑞安联合体的监狱遇见了联邦士兵科尔·希克森。这段时间内，希克森教会了雷诺如何熬过凯莫瑞安联合体的残酷拷问。
科尔宾·弗尔斯派他的儿子科林潜藏在帝国内部，而帝国此时正在搜捕科林，意图开发他的灵能。科林逃到了尤摩扬——独立于帝国的一个泰伦政府。
吉姆·雷诺加入联邦海军陆战队，并在此碰到了泰凯斯·芬利。在其后的泰伦联邦与凯莫瑞安联合体之间的战争中，第321殖民地突击营（成员包括雷诺和芬利）首当其冲，一战成名，被称为“天堂恶魔”。
年轻的科林被帝国捕获，并被送到了幽灵军校，与此同时，他的父亲科尔宾在尤摩扬发表了反对帝国的言论。作为回应，科尔宾成为了帝国的暗杀对象。
星际纪元2488-2489年
星际纪元2501年
作为对联邦卑劣进行资源掠夺的还击，莫瑞安矿工联盟和凯兰尼斯运输协会联合发动了武装起义，并成立了凯莫瑞安联合体。他们的口号是保护本地的商业采矿活动，并向其他受联邦剥削的矿工行会提供军事援助。凯莫瑞安联合体和泰伦联邦之间剑拔弩张，战争爆发。这次战争史称凯联之战。
“诺娃”特拉从被毁灭的家园塔桑尼斯逃了出来，在幽灵军校受到另一个灵能拥有者的训练，以锻炼自己的灵能。
星际纪元2485年
星际纪元2502年
阿克图尔斯·蒙斯克从斯蒂尔灵学院毕业，并不顾父母的反对，报名参军，并成为联邦海军陆战队的一员。
阿克图尔斯召回他的儿子瓦伦里安，打算让其成为皇帝，而瓦伦里安则对此十分冷漠。
星际纪元2478年
联邦电视新闻网的记者凯特·洛克维尔进入帝国部队，负责进行爱国宣传。在这段服役期，她遇见了前联邦电视新闻网记者迈克尔·利伯蒂，并发现了隐藏于帝国表面之下的黑暗真相。
莎拉·凯瑞甘出生。她天生具有强大的灵能。
汤姆森·考利为了掩盖其刺杀阿克图尔斯·蒙斯克的行动，计划消灭“好战者”成员——该部队已经解散。在行动前，他先召集了“好战者”的成员去杀死吉姆·雷诺，他认为这次行动可以赢得蒙斯克的欢心。而负责这次行动的成员则是前联邦士兵科尔·希克森，他在凯莫瑞安联合体的莫里安监狱里拯救了雷诺。
星际纪元2473年
泰伦、异虫、星灵三方在科普卢星区的军队为了控制行星阿提卡上的萨尔纳加神庙而陷入混战。其间，一些好战分子为了某些个人目的也参与了这场混战。
吉姆·雷诺出生于特蕾西和卡罗尔·雷诺在边远之地——夏伊洛的家中。
凯莫瑞安联合体的工作人员来到了一个荒凉的行星，希望能发掘一些有价值的遗迹。在发掘过程中，他们发现了该行星居民失踪的可怕真相。
星际纪元2470年
一个神经质的维京飞行员乔恩·迪勒上尉在一次武装练习中攻击了乌萨的无辜殖民者。而他的学生，韦斯·卡特则阻止了他疯狂的杀戮行为。
泰凯斯·芬利出生。他将在凯联之战里成为吉姆·雷诺的好朋友。
桑丁·福斯特，一位熟练的雷神驾驶员，同他的两名忠实队友一起勇敢的进入了玛·莎拉的一处泰伦废墟，在取得任务物品后，福斯特发现了一个以前从未被发现的秘密。
星际纪元2464年
星际纪元2503年
阿克图尔斯·蒙斯克出生。他成为了联邦精英的一员。
帝国科学家捕获了星灵执政官穆瓦丹，并对其进行实验，以此来获取星灵灵能完全形态的信息——卡拉。由疯狂的斯坦利·铂金斯博士率领，研究人员使用了各种违反伦理道德的手段来研究灵能。
星际纪元2460年
考古学家杰克·拉姆西对一座萨尔纳加神庙进行了研究，但情况很快失去了控制，杰克受到了一个神秘的星灵守护者影响，他的思维与之融合，无数星灵的历史记忆从他脑海里涌现出来。
通过在其他行星建立殖民地，塔桑尼斯行星成为了泰伦联邦（一个强大的专制政府）的首都。
杰克·拉姆西继续来到艾尔行星进行探险，在脑海中的星灵守护者指令下，他发现了行星地下的暗影迷宫，发现了一个或许可以拯救宇宙的神圣水晶。
星际纪元2323年
一些受过神秘训练的帝国幽灵开始失踪。诺娃·特拉从幽灵军校毕业，开始调查失踪事件，并发现了一个恐怖的秘密。
阿尔戈号、萨仁格号、里根号、内加法号四艘超级航母从地球运输罪犯时，在距目的地很远的科普卢星区迫降。幸存者们开荒发展了莫瑞亚，尤摩扬和塔桑尼斯这三个行星，以此建立了一个新的人类社会，并向其他行星扩张。
杰克·拉姆西在穿越艾尔行星的萨尔纳加传送门时，同保镖罗斯玛丽·达尔分开，罗斯玛丽被萨古拉斯部分星灵流亡者杀死。但杰克仍然不知去向。杰克在时间耗尽之前将星灵保护者从自己的思维里分离了出去，否则两者都将死亡。
星际纪元2259年
莫比斯基金会的一个调查队，调查了一座科普卢星区的萨尔纳加建筑。在研究中，这些科学家发现了一股潜伏在古代遗迹中的黑暗力量。
塔萨达尔出生。后来他将成为星灵的母星——艾尔行星的执政官。
科林从帝国的收割者部队退役后打算开始自己的新生活，但是他难以摆脱过去的麻烦，因为一名前队友不期而至……
星际纪元2143年
一名夜总会歌手斯塔里·蕾丝发现自己正处于帝国和凯莫瑞安联合体外交纷争的中心
黑暗圣堂武士泽拉图出生。若干年后他将帮助分裂的星灵社会走向统一。
星际纪元2504年
星际纪元1865年
心灰意冷的吉姆·雷诺回到了玛·萨拉，日复一日地与内心的挫败感斗争。
一群被母星——艾尔行星放逐的星灵流亡者拒绝加入卡拉。这些流亡者称自己为黑暗圣堂武士，定居于行星萨古拉斯。这次分离行为导致星灵种族分裂为两个派系，史称大分裂。
艾萨克·怀特是帝国军重武装劫掠者部队中的一员，奉命去救援一队被海盗攻击的凯莫瑞安联合体矿工。但随着局势的发展，怀特救援任务的真相渐渐地显露出来：那是一次机会，让他消除记忆深处的恐惧的机会，那恐怖的记忆从他在凯联之战中当炸弹专家以来就一直折磨着他。
星际纪元1500年
在接近四年的沉寂之后，刀锋女王和她的虫群再一次在科普卢星区肆虐。在纷飞的战火中，吉姆·雷诺不屈不挠地对抗着压榨人民的帝国……以及阴魂不散的昨日记忆。